（一）辦公室（應急辦）

（二）黨委辦公室（工會）

（三）人事部（紀檢監察室）

（四）財務部

（五）業務管理部

（六）質量管理部（藥品化妝品抽檢監測秘書處）

（七）監督抽樣辦公室

（八）培訓部

（九）信息統計部

（十）科研管理部

（十一）食品藥品技術研究中心

（十二）中藥檢測室

（十三）化學藥品檢測室

（十四）抗生素藥品檢測室

（十五）化妝品檢測室

（十六）藥品包裝材料及輔料檢測室

（十七）生物制品疫苗批簽發檢測室

（十八）微生物檢測室

（十九）安全評價研究室